Xã Yên Trung nằm ở phía Đông Bắc huyện Yên Phong, cách Thị trấn Chờ 4km, địa hình bằng phẳng, liền kề với con sông Cầu ở địa thế rất thuận lợi cho việc phát triển sản xuất công nghiệp. Phía Bắc giáp với xã Dũng Liệt. Phía Nam giáp với xã Đông Tiến và quốc lộ 18. Phía Đông giáp với xã Thụy Hòa. Phía Tây giáp với xã Đông Tiến.